Le résultat du scrutin a été favorable à Massoud Pezeshkian, qui a obtenu 53,3% des plus de 30 millions de votes comptabilisés. Saeed Jalili a obtenu 44,3% des voix. Le second tour a eu lieu après qu'aucun candidat n'ait obtenu la majorité au premier tour de l'élection du 28 juin, qui a vu un taux de participation historiquement bas de 40 %. Les élections ont été convoquées après la mort de l'ancien président iranien, Ebrahim Raisi, dans un accident d'hélicoptère en mai, dans lequel sept autres personnes ont également perdu la vie. Avant même que les résultats définitifs ne soient proclamés par le ministère iranien de l'Intérieur, les partisans de Pezeshkian étaient descendus dans les rues de Téhéran et d'un certain nombre d'autres villes pour célébrer leur victoire. Les vidéos publiées sur les réseaux sociaux montraient principalement des jeunes dansant et agitant le drapeau vert emblématique de sa campagne, tandis que les voitures qui passaient klaxonnaient. Pezeshkian, chirurgien cardiaque de 71 ans et membre du parlement iranien, critique la tristement célèbre police des mœurs iranienne et a fait sensation après avoir promis « l'unité et la cohésion », ainsi que la fin de « l'isolement » de l'Iran du monde. Il a également appelé à des « négociations constructives » avec les puissances occidentales sur un renouvellement de l’accord nucléaire de 2015, dans lequel l’Iran a accepté de limiter son programme nucléaire en échange d’un assouplissement des sanctions occidentales.
Son rival, Saeed Jalili, est favorable au statu quo. L'ancien négociateur sur le nucléaire bénéficie d'un fort soutien au sein des communautés les plus religieuses du pays. Jalili est connu pour sa position anti-occidentale radicale et son opposition au rétablissement de l'accord nucléaire, qui, selon lui, franchit les « lignes rouges » de l'Iran. Le taux de participation au dernier tour de scrutin a été de 50 %, soit un taux plus élevé que celui du premier tour la semaine dernière, où le taux de participation avait été le plus faible depuis la révolution islamique de 1979, dans un contexte de mécontentement généralisé, mais il reste néanmoins considérablement faible. Le mécontentement généralisé a conduit des millions de personnes à boycotter les élections. Le manque de choix parmi les candidats, dominés par les islamistes radicaux, et l’impossibilité d’un véritable changement tant que le guide suprême contrôle étroitement les politiques ont ajouté à leur frustration. Certains de ceux qui n’avaient pas voté au premier tour ont été persuadés de voter pour le Dr Pezeshkian cette fois-ci pour empêcher Jalili de devenir président. Ils craignaient qu’en cas de victoire, l’Iran se dirige vers une plus grande confrontation avec le monde extérieur et qu’il lui inflige davantage de sanctions et un plus grand isolement.
Pour se présenter, les deux candidats ont dû passer par un processus de sélection mené par le Conseil des gardiens, un organe composé de 12 religieux et juristes qui détiennent un pouvoir important en Iran. Ce processus a entraîné l’élimination de 74 autres candidats, dont plusieurs femmes. Le Conseil des gardiens a déjà été critiqué par des groupes de défense des droits de l’homme pour avoir disqualifié des candidats qui n’étaient pas suffisamment loyaux envers le régime. Après des années de troubles civils - culminant avec les manifestations anti-régime qui ont secoué le pays en 2022-23, de nombreux Iraniens jeunes et de la classe moyenne se méfient profondément de l'establishment et ont jusqu'à présent refusé de voter. Sur les réseaux sociaux iraniens, le hashtag persan « minorité traîtresse » est devenu viral, exhortant les gens à ne voter pour aucun des candidats et qualifiant de « traître » quiconque le ferait. Mais le guide suprême, l’ayatollah Ali Khamenei, a rejeté les suggestions selon lesquelles la faible participation représenterait un rejet de son régime. « Il y a des raisons et les politiciens et les sociologues les examineront, mais si quelqu'un pense que ceux qui n'ont pas voté sont contre l'establishment, il a clairement tort », a-t-il déclaré. Dans un geste rare, il a reconnu que certains Iraniens n'acceptent pas le régime actuel. « Nous les écoutons et nous savons ce qu'ils disent, ce n'est pas comme s'ils étaient cachés et invisibles », a déclaré Khamenei.